1. "нет возможности удаленной установки новой версии антивируса с сетевой папки." - Возможность есть, но нужно указывать путь до файла формата File://
2. "удаленная установка новой версии отрабатывает если только активная учетная запись пользователя имеет полномочия администратора. (нет возможности в задачи задать логин и пароль для запуск от имени.) " - Можно запустить службу ERA от имени доменного администратора.
3. "нет возможности отключение получения уведомления от центра обеспечения безопасности Windows в клиентах. " - Есть, но в настройках агента и в настройках антивируса.