Оказывается, mysql odbc connector пытается подключиться через сокет, если имя хоста совпадает с localhost. Достаточно использовать 127.0.0.1 вместо localhost.

Столкнулся с такой же проблемой (как в первом посте).
Пишу для тех, кто столкнётся с ней и найдёт эту тему в поисковиках.
Скорее всего проблема в mysql odbc connector.
Убедиться, что проблема именно в нём, достаточно просто. Прежде всего, в логах не будет ничего похожего на [unixODBC][Driver Manager], как в первом посте. Также в логах mysql сервера не будет отмечено никаких попыток подключения, так как подключение, собственно, и не происходит.
После этого нужно настроить DSN запись для базы mysql используя драйвер, настроенный согласно руководству ERA и с помощью утилиты isql попробовать к ней подключиться. Подключиться не получится, тк произойдёт floating point exception.
Если все проверки заканчиваются именно так, то проблема именно в mysql odbc connector.
Чтобы решить эту проблему нужно скачать с сайта mysql последнюю версию этого коннектора, распаковать где-нибудь и настроить её использование.
После чего в логах установщика появится ошибка про сокет. Решение тоже простое: сначала надо создать симлинк от того места, где коннектор ищет сокет к самому сокету, создаваемому mysql. В результате установщик сможет проверить подключение, создаст все необходимые файлы и сохранит настройки. После этого необходимо найти файл настроек (StartupConfiguration.ini) и дописать в DatabaseConnectionString путь к сокету.