Конфигурация применяеться для клиентов ERA, т.е. указан сервер удаленного администрирования в настройках... Нельзя удаленно просканировать компы с админскими правами и применить конфигурацию... можно только установить, например, новую версию антивируса с новыми настройками...
Поэтому очень желательно распространить данные настройки через доменные политики, и при изменении настроек сервера... клиент автоматом будет подхватывать правильный сервер из политик домена...