Увы не добавлял директорию целиком, только отдельно-взятые файлы, но дома сделал те же манипуляции пофайлово и данные файлы не удалялись ... проблема пока остается загадкой .. как только буду у того клиента, проверю по целому каталогу.

Вчера возникла подобная же ситуация у одного моего клиента. После установки Eseta 5-го, он убил один крякнутый объект ... опция "восстановить и исключить из сканирования" не была активна ... я временно отрубил защиту, зашел в исключенные приложения и в ручную добавил данный объект, с соответствующим к нему путем ... после чего в карантине восстановил его ... при заходе в ту исключенную папку объект заново исчезает и переносится в карантин ... прописывал в исключениях все файлы данной папки аналогичная пробл ... перемещал в другие директории или кидал другие потенциально опасные объекты, прописывая их в исключениях, проблема не изчезла .... переставлял полностью нод ... аналогичная ситуация.
Пробл возник только у одного человека .. у меня дома все работает великолепно. Не могу понять в чем могла быть причина.
Спасибо заранее, если знаете ответ.